La eutrofización es el enriquecimiento de nutrientes en los ecosistemas acuáticos. Comienza cuando el agua recibe un aporte, por ejemplo procedente de la actividad agrícola, que favorece la proliferación excesiva de materia orgánica. Esto provoca un incremento acelerado de algas y otras plantas verdes que cubren la superficie del agua, evitando que la luz solar llegue a las capas inferiores. El agua se enturbia, y al disminuir la cantidad de luz la vegetación muere por no poder realizar la fotosíntesis, incrementándose la actividad de microorganismos que se alimentan de materia orgánica muerta. Como consecuencia de esto, los niveles de oxígeno disuelto disminuyen rápidamente, impidiendo la vida de los organismos acuáticos que lo necesitan para realizar sus procesos biológicos.
La acumulación de nitratos en las aguas superficiales es atribuida principalmente a las inadecuadas prácticas agrícolas que aplican en exceso y de forma incorrecta los fertilizantes nitrogenados, y producen el enriquecimiento de los nutrientes disueltos que arrastran, generando problemas de eutrofización en las aguas que las reciben y disminuyendo su calidad. Es en esta línea en la que se enmarca el proyecto EUTROMED.